Jake bevindt zich midden in het planetaire conflict tussen de Kaijus, buitenaardse wezens, en de Jaegers, gigantische robots bestuurd door mensen. Jake krijgt de kans om de legende van zijn vader voort te zetten met de hulp van zijn zus, Mako Mori, die een dappere generatie piloten leidt. Samen zullen ze de grootste verdedigingsmacht worden die de aarde ooit heeft gekend.